RでPDFファイルをPNGファイルに変換する（Fontconfig error: Cannot load default config file）

RでPDFファイルをPNGファイルに変換する方法を検索したので、その方法をメモします。

PDFからPNGへの変換が必要になった理由

ggplotを使っていて、geom_line(linetype = "dotted")やgeom_path(linetype = "dashed")のように、点線や破線をプロットしようとした時に、データポイントが多すぎると、PNGで保存した場合には点線や破線が細かすぎて直線に見えてしまう。

PDFファイルで出力すると、linetypeが正しく反映され、点線や破線に見える。

また、他に以下の３つの理由でPNGファイルで出力したい。

• データ点が多すぎるとPDFファイルをPowerPointなどに貼り付けた際に動作が遅くなる。
• PDFを貼り付けたPowerPointファイルをWindowsユーザーに渡すと、半透明の塗り潰しが表示されない。
• PDFを貼り付けたPowerPointをPDFに変換してWindowsユーザーに渡すと、画像の淵に線が入る。

上記の問題の解決策があれば教えてほしい。。

これまではPDFファイルに出力して、プレビューアプリでPNGファイルに変換していた。

ファイル数が多くなればその分手間も多くなるし、データ点が多い場合はPDFが重くなって書き出しにも時間がかかる。

RでPDFファイルとして出力して、続けて変換してやれば良いと思った次第。

package 'pdftools'のインストールとエラー

PDFファイルから情報を取得したり、PDFファイルを画像形式に変換したり、PDFファイルを画像ファイルとして読み込んでRでの解析に使ったりするためのライブラリ。

CRANから入手できる。（エラーが出るのでソースからインストールした。後述）

CRAN - Package pdftools

pdftools.pdf

PDFからPNGへの変換にはpdf_convert()関数を使う。

環境は
macOS 10.15.4
R 4.0.0

> # install.packages("pdftools")
> # library(pdftools)
> test2 <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10)
> test <- ggplot() + geom_line(data = test2, aes(x = x, y = y))
> ggsave(test, filename = "pdffile.pdf")
> pdf_convert(pdf = "pdffile.pdf", format = "png", pages = NULL, filenames = NULL,
+ dpi = 72, antialias = TRUE, opw = "", upw = "", verbose = TRUE)
Converting page 1 to pdffile_1.png...PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
PDF error: Couldn't find a font for 'Helvetica'
 done!
[1] "pdffile_1.png"
Fontconfig error: Cannot load default config file

RStudioで一度できていたのだけど、R.appで再現しようとしたらエラーが出て、RStudioでも同様のエラーが出るようになった。

ソースからインストールする方法を試してみる。

とりあえず、ウェブサイトの手順通りにやってみた。

Text Extraction, Rendering and Converting of PDF Documents • rOpenSci: pdftools

brew install poppler

Homebrewのアップデートが始まって、しばらくするとインストールが始まった。結構長い。

インストールが終わって、

> library(pdftools)
> pdf_convert(pdf = "pdffile.pdf", format = "png", pages = NULL, filenames = NULL,
+  dpi = 72, antialias = TRUE, opw = "", upw = "", verbose = TRUE)
Converting page 1 to pdffile_1.png... done!
[1] "pdffile_1.png"
>

無事エラーがなくなった。

pdf_convert()関数の使い方

> # pdftoolsの読み込み
> library(pdftools)
> # ワーキングディレクトリのpdffile.pdfというPDFファイルを300dpiのpngfile.pngに変換
> pdf_convert(pdf = "pdffile.pdf", format = "png", pages = NULL, filenames = "pngfile.png",
+  dpi = 300, antialias = TRUE, opw = "", upw = "", verbose = TRUE)

• pdfに変換したいPDFファイルのパスをいれる。
• formatに出力したいファイル形式を指定。
• filenamesに出力するファイル名をいれる。拡張子は必要。NULLの場合は、元のPDFファイル名に_1を付けて拡張子を変えた名前になる。
• dpiで解像度を指定。

他のオプションはわかりません。。

まとめ

package 'pdftoos'のpdf_convert()関数を使えば、PDFファイルをPNGファイルに変換できる。

install.packages("pdftools")ではフォントに関するエラーが起きた。

brewを使ってソースからインストールすることで解決した（多分）。

にしても、一度できてたやつができなくなったのはなぜ。